Ersetzt einfach die Parameter am Anfang der Datei, mit den bei euch passenden Werten und führt das Script auf eurem Server auf. Nachdem es fertig durchgelaufen ist, sollte es, in eurem Backup Ordner, für jede Datenbank eine SQL Datei geben.

#!/bin/sh

USERNAME=root
PASSWORD=ROOT_PASSWORT
MYSQL=/usr/bin/mysql
MYSQLDUMP=/usr/bin/mysqldump
DUMPDIR=/home/backup

DATABASES=`$MYSQL -p$PASSWORD -u $USERNAME --execute="SHOW DATABASES;" | awk '{print $1}'`

for s in $DATABASES;
do
        if [ $s != "information_schema" ] && [ $s !="Database" ]
        then
                 `$MYSQLDUMP -u$USERNAME -p$PASSWORD $s < $DUMPDIR/$s.sql`
        fi
done

SQL Error: Thread stack overrun: 8824 bytes used of a 131072 byte stack, and 128000 bytes needed. Use 'mysqld -O thread_stack=#' to specify a bigger stack.

Schuld ist eine Voreinstellung bei Debian basierten Distributionen. In der /etc/mysql/my.cnf wird der Wert von thread_stack auf 128k festgelegt. Erhöht man diesen Wert auf 192k (MySQL Standard), funktionieren auch einfache Stored Procedures wieder.